Для данного практикума номер моего метаболического пути map00404.
Рис 1. Референсный путь
Я выбрала реакцию R09568(4'-demethylrebeccamycin D-glucose-lyase).
Рис 2. Референсный путь с отмеченной реакцией
Информация о реакции
Фермент реакции-4.3.3.5, 4'-деметилребеккамицинсинтаза. Его функция: катализирует предпоследнюю стадию биосинтеза ребеккамицина, алкалоида индолокарбазола, который ингибирует топоизомеразу 1.
Класс фермента: 4, то есть синтаза.
Подкласс фермента: 3, характеризует вид субстрата.
Под-подкласс: 3, что означает тип отщепляемой группы.
Код четвертого уровня: 5, порядковый номер для данного под-подкласса.
Можем посмотреть метболический путь для двух оргнизмов: Aspergillus fumigatus и Aspergillus flavus.
Рис 3. Aspergillus fumigatus
Рис 4. Aspergillus flavus
У Aspergillus fumigatus 9360 генов и 128 метаболических путей.